NộI Dung
- Một kiểu gen và một kiểu hình là gì?
- Giải thích về kiểu gen HIV
- Giải thích về HIV Phenoytyping
- Khi nào thì thực hiện xét nghiệm đề kháng di truyền?
Khi điều trị thất bại, các kết hợp thuốc thay thế phải được lựa chọn để ngăn chặn quần thể vi rút kháng thuốc mới này. Kiểm tra tính kháng di truyền giúp tạo điều kiện thuận lợi cho việc này bằng cách xác định các loại đột biến kháng thuốc trong "nhóm vi-rút" của một người, đồng thời xác định mức độ nhạy cảm của những vi-rút đó với các tác nhân kháng vi-rút.
Hai công cụ chính được sử dụng để xét nghiệm di truyền kháng HIV: Xét nghiệm kiểu gen HIV và Xét nghiệm kiểu hình HIV.
Một kiểu gen và một kiểu hình là gì?
Theo định nghĩa, kiểu gen chỉ đơn giản là cấu tạo di truyền của một sinh vật, trong khi kiểu hình là những đặc điểm hoặc tính trạng có thể quan sát được của sinh vật đó.
Các xét nghiệm kiểu gen (hoặc xác định kiểu gen) có chức năng bằng cách xác định các hướng dẫn được thừa kế trong mã hóa di truyền của tế bào hoặc DNA. Các xét nghiệm kiểu hình (hoặc xác định kiểu hình) xác nhận sự biểu hiện của các chỉ dẫn đó dưới ảnh hưởng của các điều kiện môi trường khác nhau.
Mặc dù mối liên hệ giữa kiểu gen và kiểu hình không phải là tuyệt đối, nhưng việc xác định kiểu gen thường có thể mang tính dự đoán kiểu hình, đặc biệt khi những thay đổi trong mã di truyền dẫn đến những thay đổi dự kiến về tính trạng hoặc đặc điểm - như trong trường hợp kháng thuốc.
Mặt khác, kiểu hình xác nhận "ở đây và ngay bây giờ." Nó nhằm mục đích đánh giá phản ứng của một sinh vật đối với những thay đổi cụ thể trong áp suất môi trường - chẳng hạn như khi HIV tiếp xúc với các loại thuốc và / hoặc nồng độ thuốc khác nhau.
Giải thích về kiểu gen HIV
Định kiểu gen HIV nói chung là công nghệ phổ biến nhất được sử dụng để kiểm tra sức đề kháng. Mục tiêu của thử nghiệm là phát hiện các đột biến di truyền cụ thể trong gag-pol vùng của virus ' bộ gen (hoặc mã di truyền). Đây là vùng mà enzym phiên mã ngược, protease và enzym tích hợp - mục tiêu của hầu hết các loại thuốc kháng vi rút - được mã hóa trên chuỗi DNA.
Bằng cách khuếch đại bộ gen HIV đầu tiên bằng công nghệ phản ứng chuỗi polymerase (PCR), các kỹ thuật viên phòng thí nghiệm có thể trình tự (hoặc "lập bản đồ") di truyền của virus bằng các công nghệ phát hiện đột biến khác nhau.
Các đột biến (hoặc sự tích tụ của các đột biến) được giải thích bởi các kỹ thuật viên phân tích mối quan hệ giữa các đột biến được xác định và tính nhạy cảm dự kiến của vi rút đối với các loại thuốc kháng vi rút khác nhau. Cơ sở dữ liệu trực tuyến có thể hỗ trợ bằng cách so sánh trình tự thử nghiệm với trình tự của một nguyên mẫu vi rút "loại hoang dã" (tức là HIV không chứa đột biến kháng thuốc).
Việc giải thích các xét nghiệm này được sử dụng để xác định tính nhạy cảm với thuốc, với số lượng lớn các đột biến chính dẫn đến mức độ kháng thuốc cao hơn.
Giải thích về HIV Phenoytyping
Phân loại kiểu hình HIV đánh giá sự phát triển của HIV của một người khi có mặt của một loại thuốc, sau đó so sánh với sự phát triển của một loại vi rút hoang dã, đối chứng trong cùng một loại thuốc.
Giống như các xét nghiệm kiểu gen, xét nghiệm kiểu hình khuếch đại vùng gag-pol của bộ gen HIV. Phần này của mã di truyền sau đó được "ghép" vào một bản sao kiểu hoang dã bằng cách sử dụng công nghệ DNA tái tổ hợp. Virus tái tổ hợp thu được được sử dụng để lây nhiễm vào tế bào động vật có vú trong ống nghiệm (trong phòng thí nghiệm).
Sau đó, mẫu vi rút được tiếp xúc với nồng độ tăng dần của các loại thuốc kháng vi rút khác nhau cho đến khi đạt được sự ức chế vi rút 50% và 90%. Các nồng độ sau đó được so sánh với kết quả từ mẫu đối chứng, kiểu hoang dã.
Các thay đổi "nếp gấp" tương đối cung cấp phạm vi giá trị mà tính nhạy cảm với thuốc được xác định. Một sự thay đổi gấp 4 lần đơn giản có nghĩa là lượng thuốc cần thiết gấp 4 lần để đạt được sự ức chế vi rút so với loại hoang dã. Giá trị gấp càng lớn, vi rút càng ít nhạy cảm với một loại thuốc cụ thể.
Các giá trị này sau đó được đặt trong phạm vi lâm sàng dưới và trên lâm sàng, với các giá trị trên quy cho mức độ kháng thuốc cao hơn.
Khi nào thì thực hiện xét nghiệm đề kháng di truyền?
Tại Hoa Kỳ, xét nghiệm kháng thuốc di truyền theo truyền thống được thực hiện trên những bệnh nhân chưa từng điều trị để xác định xem họ có bị "mắc phải" bất kỳ loại kháng thuốc nào hay không. Các nghiên cứu ở Hoa Kỳ cho thấy rằng từ 6% đến 16% vi rút lây truyền sẽ kháng với ít nhất một loại thuốc kháng vi rút, trong khi gần 5% sẽ kháng với nhiều hơn một loại thuốc.
Thử nghiệm di truyền kháng thuốc cũng được sử dụng khi nghi ngờ kháng thuốc ở những người đang điều trị. Xét nghiệm được thực hiện khi bệnh nhân đang điều trị thất bại hoặc trong vòng bốn tuần sau khi ngừng điều trị nếu tải lượng vi rút lớn hơn 500 bản sao / mL. Xét nghiệm kiểu gen thường được ưa thích hơn trong những trường hợp này vì chúng có chi phí thấp hơn, thời gian quay vòng nhanh hơn và mang lại độ nhạy cao hơn để phát hiện hỗn hợp vi rút kiểu dại và vi rút kháng thuốc.
Sự kết hợp giữa xét nghiệm kiểu hình và kiểu gen thường được ưu tiên cho những người có cơ địa phức tạp, đa kháng thuốc, đặc biệt đối với những người tiếp xúc với chất ức chế protease.